Métabolomique

De la production des données aux approches analytiques et aux applications

Lille, 15 octobre 2019


La métabolomique est un champ scientifique en plein développement qui permet l’identification et la quantification des métabolites présents à un instant donné, dans des conditions données au sein de la cellule. Ces mesures permettent de rendre compte des changements métaboliques qui s’exercent au sein d’un système comme résultante de l’expression du génome en interaction avec son environnement. Les applications sont nombreuses et transverses, que ce soit en santé, en microbiologie, en biologie végétale ou en nutrition par exemple.

L'objectif de cette journée est de présenter à la fois les principes de bases de la métabolomique et les ressources biostatistiques et bioinformatiques disponibles pour l'analyse de ces données.


Programme


  • 9h15-9h40: Café de bienvenue
  • 9h40-9h45: Introduction de la journée
  • 9h45-10h35: 20 ans de métabolomique, Dominique Rolin, directeur de MetaboHUB, Bordeaux PDF
  • 10h35-11h20: Workflow4metabolomics (W4M), portail dédié à l’analyse métabolomique: extraction de données, normalisation, analyses statistiques et annotations, Jean-François Martin, INRA Toulouse PDF
  • 11h20-11h40: Pause
  • 11h40-12h25: Experimental design and data treatment in metabolomics applied to nutrition and health, Mélanie Pétéra, PFEM, MetaboHUB-Clermont, Univ Clermont Auvergne, INRA, UNH PDF
  • 12h25-12h45: Metabolomics in Alzheimer's disease, Vincent Damotte, Inserm U1167, Institut Pasteur de Lille PDF
  • 12h45-14h30: Déjeuner (RU Pariselle)
  • 14h30-15h15: Connecting the dots: metabolic networks for metabolome mining, Fabien Jourdan, UMR 1331 Toxalim, INRA Toulouse PDF
  • 15h15-16h00: Data sciences for deep phenotyping and precision medicine, Etienne Thevenot, CEA, LIST, Laboratory for data sciences and decision, MetaboHUB PDF
  • 16h00-16h20: Métabolomique appliquée à l’identification de biomarqueurs en sélection variétale, Philippe Hance, Institut Charles Viollette, Université de Lille PDF
  • 16h20-16h40: La bioinformatique des peptides nonribosomiques, des métabolites secondaires microbiens remarquables, Valérie Leclère, Institut Charles Viollette, Université de Lille PDF


Inscription

L'inscription est gratuite, mais obligatoire. Elle comprend les pauses cafés et le déjeuner.

Formulaire

Date limite: 5 octobre 2019


Accès

La journée se tient à Polytech'Lille, amphi Migeon (rez-de-chaussée). La station de métro la plus proche est Quatre Cantons, terminus de la ligne 1.

Plan d'accès


Comité d'organisation

Philippe Hance (ICV), Valérie Leclère (IVC), Pierre Pericard (bilille), Hélène Touzet (CRIStAL)